工作方式是指鼠标采用什么工作原理或方式进行工作。常见的鼠标工作方式有滚轮式和光电式等类型。

滚轮式
    滚轮式是最常见的鼠标，其在外观方面的最大特点是在底部的凹槽中有一个起定位作用从而使光标移动的滚轮。滚轮式鼠标按照工作原理又可分为第一代的纯机械式和第二代的光电机械式（简称光机式）。
    （1）纯机械式
    纯机械式鼠标，现在世面上很少见到了。在它的底部有一个滚球，当推动鼠标时，滚球就会不断触动旁边的小滚轮，产生不同强度的脉波，通过这种连锁效应，电脑才能运算出游标的正确位置。  
    （2）光机式
    这就是平常所说的机械式鼠标，它是一种光电和机械相结合的鼠标。它的原理是紧贴着滚动橡胶球有两个互相垂直的传动轴，轴上有一个光栅轮，光栅轮的两边对应着有发光二极管和光敏三极管。当鼠标移动时，橡胶球带动两个传动轴旋转，而这时光栅轮也在旋转，光敏三极管在接收发光二极管发出的光时被光栅轮间断地阻挡，从而产生脉冲信号，通过鼠标内部的芯片处理之后被CPU接收，信号的数量和频率对应着屏幕上的距离和速度。

光电式
    光电鼠标产品按照其年代和使用的技术可以分为两代产品，其共同的特点是没有机械鼠标必须使用的鼠标滚球。
    第一代光电鼠标由光断续器来判断信号，最显著特点就是需要使用一块特殊的反光板作为鼠标移动时的垫。这块垫的主要特点是其中那微细的一黑一白相间的点。原因是在光电鼠标的底部，有一个发光的二极管和两个相互垂直的光敏管，当发光的二极管照射到白点与黑点时，会产生折射和不折射两种状态，而光敏管都这两种状态进行处理后便会产生相应的信号。从而使电脑作出反应，一旦离开那块垫，那光电鼠标就不能使用了。
    目前市场上的光电鼠标产品都是第二代光电鼠标。第二代光电鼠标的原理其实很简单：其使用的是光眼技术，这是一种数字光电技术，较之以往机械鼠标完全是一种全新的技术突破。

    光电感应装置每秒发射和接收，实现精准、快速的定位和指令传输。另一优势在于光眼技术摒弃了上一代光电鼠标需要专用鼠标板的束缚，可在任何不反光、不透明的物体表面使用，使用它最大的好处就是不象机械式鼠标那样需要常常清洁鼠标球，而且其分辨率和刷新率都比机械式鼠标高得多，高档光电鼠标定位非常精确。一般来说，光电鼠标的起步就是很高的，也就是说，大部分光电鼠标均是人体工程学设计，这样可以让消费者拥有一个更合适的消费理由。

指纹鼠标
    指纹鼠标是一种特殊功能鼠标，是具有指纹采集、识别功能的鼠标，适用于对安全性要求较高的个人、办公、企事业等各类行业企业。因其价格较高，并不适合普通个人用户。

    随着办公自动化的普及，使我们的日常工作无法离开电脑，每个电脑使用者都会将自己重要的数据和文件设置密码进行加密，以保护属于自己的机密或隐私。但这种传统的密码有明显的缺点，那就是，密码容易被忘记、密码输入时容易被别有用心者窥视和获取、密码容易被破解等等。针对这一不足，计算机安全管理系统有了一个新的加密方式，就是指纹识别加密。
    指纹鼠标上集成了一个指纹采集传感器，每次开启电脑时，使用者将特定的手指（一般是大姆指）放在传感器窗口，计算机自动进行扫描，然后与使用者存储在系统中的指印比较识别，就可方便、安全地连接到主机开始工作，这样不用担心无关人员非法进入。指纹鼠标可以在登陆、恢复屏幕保护的时候使用，也可以用在解压加密文件的时候使用，其在安全性方面的主要指标是本人拒绝率和别人容许率以及指纹图象传输率（该参数决定指纹的采集、识别速度）。目前的主流产品在这本人拒绝率和别人容许率上都达到了很低的出错率，而指纹图象传输率也可达每秒可达十几帧。